南京晓庄学院国有资产管理处成立于2015年，由原实验室与设备管理处改编而成。全面负责学校国有资产的管理，制定学校资产管理、采购与招投标等规章制度，行使学校资产的所有权、管理权、租赁权、转让权、处置权等，办理资产采购、招投标、经济合同签订等事宜。

国有资产管理处设有两个科室：设备管理科、招投采购科。